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武漢愛基百客生物科技有限公司(簡稱愛基百客),位于武漢高農(nóng)生物園,辦公面積逾3000平方米,是一家專注于表觀組學、單細胞時空組學和高通量測序分析服務的新型生物科技企業(yè)。


公司旨在為客戶提供專業(yè)的科研服務,運營至今合作的科研客戶近千家,涵蓋國內知名科研院所、高校以及相關生物企業(yè),運營至今銷售額超1億元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國際高水平學術期刊發(fā)表,受到了客戶廣泛好評,是國內成長最迅速的多組學科研服務企業(yè)之一。

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CUT&Tag項目文章(IF=16.6)| 表觀+代謝組揭示轉錄因子LHX2在前列腺癌神經(jīng)內分泌分化的新機制


神經(jīng)內分泌前列腺癌(NEPC)是去勢抵抗性前列腺癌(CRPC)的一種致命亞型,常由抗雄激素治療后的神經(jīng)內分泌轉分化(NEtD)引發(fā)。NEPC特征為神經(jīng)內分泌標志物(如SYP、NCAM1)表達增加,其發(fā)生與轉錄因子失調、表觀遺傳異常(如DNA甲基化)及新發(fā)現(xiàn)的組蛋白乳酸化修飾密切相關。其中,LIM家族轉錄因子LHX2在NEPC及小細胞肺癌中均過表達,并與不良預后相關,提示它可能在驅動NEtD中扮演著“先驅”轉錄因子的關鍵角色,但其具體功能和機制尚待深入闡明。

西京醫(yī)院秦衛(wèi)軍教授及張瑞教授團隊在國際權威期刊Cancer Research發(fā)表題為“LHX2 Rewires the Metabolic and Epigenetic Landscape to Drive Tumor Progression in Prostate Cancer”的研究成果闡明了一種相互的代謝-表觀遺傳機制,涉及糖酵解和轉錄因子LHX 2之間的正反饋回路,促進PCa進展,揭示了LHX 2在協(xié)調NEPC發(fā)展中的潛在作用,為治療這種侵襲性癌癥表型和克服耐藥性提供了假定的治療靶點。愛基百客為該研究提供了CUT&Tag的技術支持

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 研究結果 

1. LHX2是前列腺癌神經(jīng)內分泌轉化的關鍵調控因子

研究經(jīng)過篩選分析發(fā)現(xiàn)轉錄因子LHX2在泛神經(jīng)內分泌癌(SCNC)中異常高表達,尤其在神經(jīng)內分泌性前列腺癌(NEPC)和小細胞肺癌(SCLC)中顯著上調。在疾病模型中,LHX2的上調與前列腺癌細胞向神經(jīng)內分泌表型轉化密切相關,并且其高表達與前列腺癌患者的不良預后顯著相關。體外實驗進一步證實,在恩雜魯胺耐藥及AR陰性前列腺癌細胞系中,LHX2與神經(jīng)內分泌標志物共同高表達。這些結果表明LHX2是驅動前列腺癌神經(jīng)內分泌分化的關鍵因子

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圖1 LHX2在泛小細胞神經(jīng)內分泌癌中選擇性表達

2. LHX2通過調控DNMT1驅動前列腺癌惡性進展

為探究LHX2促進前列腺癌譜系可塑性的機制,本研究結合轉錄組分析與已有神經(jīng)內分泌(NE)標簽,發(fā)現(xiàn)DNA甲基轉移酶DNMT1是其關鍵下游靶點。數(shù)據(jù)分析顯示,LHX2與DNMT1的表達在多種癌癥(包括NEPC和SCLC)中顯著正相關,且高DNMT1水平與患者不良預后相關。機制上,通過CUT&Tag、ChIP-qPCR及熒光素酶報告基因實驗證實,LHX2能夠直接結合到DNMT1的啟動子區(qū)域,從而正向調控其轉錄表達。該發(fā)現(xiàn)揭示了LHX2通過直接激活DNMT1,進而促進神經(jīng)內分泌表型和腫瘤生長的分子通路。

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圖2 DNMT 1介導了LHX2的致癌功能

3. 乳酸-H3K18la-LHX2正反饋環(huán)路驅動前列腺癌神經(jīng)內分泌轉化

本研究揭示了在恩雜魯胺耐藥性前列腺癌(NEPC)中,糖酵解衍生的乳酸通過表觀遺傳機制與轉錄因子LHX2構成一個驅動腫瘤惡性進展的正反饋環(huán)路。研究發(fā)現(xiàn),耐藥細胞(LNCaP-ENZR)糖酵解通路顯著增強,表現(xiàn)為關鍵酶(GLUT1、HK1、PFKP、LDHA)上調、乳酸含量升高及細胞外酸化率增加。累積的乳酸誘導了組蛋白乳酸化修飾,特別是H3K18la,該修飾在臨床NEPC樣本及小鼠模型中水平顯著升高。

機制上,H3K18la能直接富集于LHX2基因的啟動子區(qū)并促進其表達,而外源性乳酸添加可增強此過程并上調神經(jīng)內分泌標志物NCAM1,反之糖酵解抑制劑2-DG則抑制該效應。功能上,乳酸處理能促進細胞活力與集落形成,而剝奪乳酸則可抑制體內腫瘤生長。另一方面,研究證實LHX2并非被動接受調控,它能夠直接結合并轉錄激活糖酵解關鍵酶LDHA的啟動子,從而反向促進乳酸生成。這形成了一個完整的自我強化循環(huán):糖酵解增強→乳酸累積→H3K18la修飾→LHX2表達上調→LHX2激活LDHA轉錄→進一步強化糖酵解與乳酸生成。該正反饋環(huán)路是推動前列腺癌譜系可塑性、神經(jīng)內分泌分化及治療抵抗的核心機制。

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圖3 LHX2介導糖酵解和組蛋白乳酸化之間的正反饋回路

4. 帕利匹韋聯(lián)合恩雜魯胺抑制前列腺癌進展的作用與機制

研究發(fā)現(xiàn)藥物帕利匹韋能有效抑制神經(jīng)內分泌前列腺癌(NEPC)進展。在機制上,帕利匹韋雖不直接影響關鍵因子LHX2的蛋白水平,但能顯著降低DNMT1、ASCL1和SYP等神經(jīng)內分泌標志物的表達,并恢復雄激素受體(AR)水平。相比之下,伊立替康僅降解AR,卻無法有效抑制神經(jīng)內分泌分化。體內實驗證實,帕利匹韋與恩雜魯胺的聯(lián)合治療相比單一用藥,能更顯著地抑制腫瘤生長,其作用包括下調NCAM1神經(jīng)內分泌標志物并恢復AR表達。這些結果表明,帕利匹韋通過調控關鍵表觀遺傳調節(jié)因子與神經(jīng)內分泌標志物,使腫瘤對恩雜魯胺重新敏感,從而有效阻礙前列腺癌進展。

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圖4 帕利匹韋通過與LHX2結合抑制NEPC進展

 研究總結 

本研究揭示了LHX2在前列腺癌中的作用機制,即LHX2在前列腺癌中的表觀遺傳學機制,在長期靶向治療的情況下,LHX2 是驅動前列腺癌發(fā)生發(fā)展的關鍵因子,細胞命運由其特定的代謝和表觀遺傳環(huán)境決定,抑制AR后糖酵解酶上調,糖酵解活性增加,產(chǎn)生乳酸化,組蛋白乳酸化激活LHX2表達,加速DNA甲基化,促進NE信號和PCa進展。針對這一機制,F(xiàn)DA批準的帕利匹韋消除了NEtD,并使PCa對恩雜魯胺敏感,將LHX2定位為NEPC的一種有前景的治療靶點。

愛基百客長期專注于表觀技術,如需開展CUT&Tag技術服務,歡迎隨時聯(lián)系我們,我們將為您提供一站式技術支持與解決方案!

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項目咨詢

 研究總結 

CUT&Tag是研究蛋白和DNA互作的新興實驗方法,該方法是通過蛋白特異性抗體引導Protein A-Tn5酶在目標蛋白結合的DNA位置進行切割并且在序列兩端加上測序接頭,經(jīng)過PCR擴增后形成可以用于高通量測序的文庫,隨后對文庫進行測序分析從而解析與目標蛋白結合的DNA片段。

產(chǎn)品優(yōu)勢:

1. 無需甲醛交聯(lián),樣本要求量低,背景干凈,可重復性好;

2. 提供從方案設計,建庫測序,到數(shù)據(jù)分析和驗證一站式服務;

3. 云平臺,多組學聯(lián)合分析深度挖掘數(shù)據(jù);

4. 項目經(jīng)驗豐富:

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實測數(shù)據(jù)

1. 抽核結果

提供“單細胞測序”標準的抽核解決方案。

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2. CUT&Tag酶切片段分布

轉錄因子/組蛋白修飾的酶切片段分布呈現(xiàn)周期性。

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3.reads密度分布圖

reads在TSS附近呈現(xiàn)明顯的富集。

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4.功能元件分布圖

Peak在基因功能元件上分布。

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5.Peak可視化

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公司主要提供表觀組學技術服務、NGS測序服務、單細胞測序服務

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