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武漢愛基百客生物科技有限公司(簡稱愛基百客),位于武漢高農(nóng)生物園,辦公面積逾3000平方米,是一家專注于表觀組學、單細胞時空組學和高通量測序分析服務的新型生物科技企業(yè)。


公司旨在為客戶提供專業(yè)的科研服務,運營至今合作的科研客戶近千家,涵蓋國內(nèi)知名科研院所、高校以及相關(guān)生物企業(yè),運營至今銷售額超1億元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國際高水平學術(shù)期刊發(fā)表,受到了客戶廣泛好評,是國內(nèi)成長最迅速的多組學科研服務企業(yè)之一。

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详细说明

MeDIP-seq

  • 產(chǎn)品介紹
  • 案例分析

MeDIP-seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing)


產(chǎn)品介紹

MeDIP-Seq (甲基化DNA免疫共沉淀測序)是一種基于富集方法研究DNA甲基化的測序技術(shù),針對不同甲基化類型選擇不同抗體。目前,主要是利用5mC/5hmC抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段,在高CpG密度、高DNA甲基化水平區(qū)域具有很好的抗體親和性,然后通過高通量測序可以在全基因組水平上進行高精度的CpG密度的高甲基化區(qū)域研究。利用MeDIP-seq技術(shù)能快速地尋找基因組上的甲基化區(qū)域,從而比較不同細胞、組織或疾病樣本間的DNA甲基化修飾模式的差異,為生物學研究或臨床應用方案提供理論依據(jù)。

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圖:MeDIP-seq建庫測序過程


技術(shù)路線:

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樣本要求:

細胞:≥1×10 7

物組織:3g

植物組織:3g

真核微生物:≥500mg


建庫測序:

測序策略:NovaSeq6000, PE150

測序深度:20-30M clean reads


項目周期:

45個工作日


案例分析

【項⽬⽂章】《hMeDIP-Seq鑒定出INPP4A是嗜酸性的慢性⿐竇炎伴⿐息⾁的⼀種新的⽣物標志物》

ThehMeDIP-SeqidentifiedINPP4Aasanovelbiomarkerforeosinophilicchronicrhinosinusitiswithnasalpolyps

期刊:Epigenomics|影響因⼦:4.357|發(fā)表時間:2022年|發(fā)表單位:武漢⼤學⼈⺠醫(yī)院


研究背景:

慢性⿐竇炎伴⿐息⾁(CRSwNP)是⼀種多因素、異質(zhì)性和社會經(jīng)濟負擔沉重的⿐腔和⿐竇炎癥性疾病。嗜酸性CRSwNP (ECRSwNP) 和⾮嗜酸性CRSwNP (NECRSwNP) CRSwNP的兩種內(nèi)分型,它們具有不同的免疫病理模式,并通過嗜酸性粒細胞浸潤的程度來區(qū)分。嗜酸性慢性⿐-⿐竇炎伴⿐息⾁( ECRSwNP)是慢性⿐-⿐竇炎伴⿐息⾁的⼀種內(nèi)型,其癥狀更嚴重,與哮喘的相關(guān)性更強,復發(fā)⻛險更⼤。⽬前尚不清楚DNA羥甲基化是否會影響ECRSwNP。


研究結(jié)果:

該研究利⽤MeDIP-seq5hmc抗體)技術(shù)分析了嗜酸性慢性⿐竇炎伴⿐息⾁、⾮嗜酸性慢性⿐竇炎伴⿐息⾁和對照組,嗜酸性慢性⿐竇炎伴⿐息⾁和⾮嗜酸性慢性⿐竇炎伴⿐息⾁之間找到了26個基因表現(xiàn)出差異的DNA羥甲基化。最后,研究發(fā)現(xiàn)INPP4A是嗜酸性慢性⿐竇炎⿐息⾁的⽣物標記物。

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圖:嗜酸性和⾮嗜酸性慢性⿐竇炎伴⿐息⾁的DNA羥甲基化反應的⽐較



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