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武漢愛基百客生物科技有限公司(簡稱愛基百客),位于武漢高農生物園,辦公面積逾3000平方米,是一家專注于表觀組學、單細胞時空組學和高通量測序分析服務的新型生物科技企業。


公司旨在為客戶提供專業的科研服務,運營至今合作的科研客戶近千家,涵蓋國內知名科研院所、高校以及相關生物企業,運營至今銷售額超1億元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國際高水平學術期刊發表,受到了客戶廣泛好評,是國內成長最迅速的多組學科研服務企業之一。

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TECHNOLOGY SERVICE

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MeRIP-seq

  • 產品介紹
  • 案例分析

MeRIP-seq(Methylated RNA immunoprecipitation sequencing)


產品介紹:

MeRIP-seq 原理是通過m6A特異性抗體對細胞內具有m6A 修飾的RNA片段進行免疫共沉淀,將富集下來的RNA片段進行高通量測序。結合生物信息學分析,即可在轉錄組范圍內對m6A修飾進行系統研究

m6AN6-methyladenosine6-甲基腺嘌呤)是真核生物mRNA內部序列中十分常見的一種甲基化修飾,同時可以功能性的調節真核生物的轉錄組從而影響mRNA的剪接、出核、定位、翻譯和穩定。m6A RNA出現在多種重要的細胞生命過程中,意味著mRNA甲基化參與了多種生物學過程,如干細胞分化、生物節律等,同時也參與了多種疾病的發生,包括腫瘤、肥胖和不育等。

MeRIP-seq  建庫流程.png

圖:MeRIP-seq建庫測序流程示意圖


分析流程:

image.png


樣本要求:

細胞:1×10

動物組織:3g

植物組織:3g

真核微生物:2g


建庫測序:

測序策略:Illumina, PE150

測序深度:20-30M clean reads


項目周期:

60個工作日


案例分析

【項目文章】《康乃馨(Dianthus caryophyllus L.)中動態m6A RNA甲基化與乙烯誘導的花瓣衰老相關,并可能調節抗氧化和代謝途徑

Dynamic m6A RNA methylation correlates with ethylene-induced petal senescence and may modulate antioxidant and metabolic pathways in carnation (Dianthus caryophyllus L.)

期刊:The Plant Journal|影響因⼦:5.7|發表時間:2025年|發表單位:華中農業大學

研究背景:

花衰老是植物生命周期中的關鍵階段,受乙烯等多種激素調控。盡管N6-甲基腺苷(m6A)RNA修飾在植物發育和逆境響應中具有重要作用,但其在乙烯誘導的花衰老中的功能尚不明確。康乃馨(Dianthus caryophyllus L.)作為乙烯敏感型切花,是研究花衰老的理想模型。本研究旨在探討m6A修飾在乙烯信號下如何動態變化,并解析其通過抗氧化和代謝途徑影響康乃馨花衰老的分子機制。

研究結果:

  在這項研究中,液相色譜-串聯質譜(LC-MS/MS)分析表明,乙烯處理顯著降低了康乃馨(Dianthus caryophyllus L.)花瓣中的m6A水平。MeRIP-seq分析進一步顯示,乙烯處理導致了m6A修飾分布模式的改變,特別是終止密碼子區域附近的富集度有所增加。進一步的研究鑒定了四個與衰老相關的基因,包括抗氧化基因(DcGST10和DcGPX8)和三羧酸(TCA)循環基因(DcACLA和DcACLB)。這些基因的m6A水平與其mRNA表達水平呈正相關。此外,我們發現沉默這些基因會顯著加速康乃馨花瓣的衰老并增加氧化應激,這突顯了m6A修飾在調節抗氧化和代謝途徑中的關鍵作用。本研究證實了康乃馨花瓣衰老過程中m6A修飾的動態變化及其潛在機制,為植物衰老過程中的表觀遺傳調控網絡提供了新的見解。


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圖:乙烯處理康乃馨花過程中m⁶A的動態分布







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