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武漢愛基百客生物科技有限公司(簡稱愛基百客),位于武漢高農(nóng)生物園,辦公面積逾3000平方米,是一家專注于表觀組學(xué)、單細胞時空組學(xué)和高通量測序分析服務(wù)的新型生物科技企業(yè)。


公司旨在為客戶提供專業(yè)的科研服務(wù),運營至今合作的科研客戶近千家,涵蓋國內(nèi)知名科研院所、高校以及相關(guān)生物企業(yè),運營至今銷售額超1億元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國際高水平學(xué)術(shù)期刊發(fā)表,受到了客戶廣泛好評,是國內(nèi)成長最迅速的多組學(xué)科研服務(wù)企業(yè)之一。

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TECHNOLOGY SERVICE

科技服務(wù)

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CUT&Tag

  • 產(chǎn)品介紹
  • 案例分享

CUT&Tag ( Cleavage Under Targets and Tagmentation )


產(chǎn)品介紹:

CUT&Tag是研究蛋白和DNA互作的新興實驗方法,該方法是通過蛋白特異性抗體引導(dǎo)Protein A-Tn5酶在目標蛋白結(jié)合的DNA位置進⾏切割并且在序列兩端加上測序接頭,經(jīng)過 PCR擴增后形成可以用于高通量測序的文庫,隨后對文庫進⾏測序分析從而解析與目標蛋白結(jié)合的DNA 片段。 

CUT&Tag具有低細胞起始量、信噪比高、背景⼲凈等優(yōu)點。

image.png

CUT&Tag實驗流程


分析流程:

CUT&Tag分析流程圖.png


技術(shù)優(yōu)勢:

CUT&Tag技術(shù)優(yōu)勢.png


樣本要求:

細胞:5×104 

動物組織:0.1 g

植物組織1 g

核微生物:300 mg

 

建庫測序:

測序策略:NovaSeq6000, PE150

測序深度:3 G


項目周期:

35個工作日 



案例分析

項目文章| CUT&Tag+轉(zhuǎn)錄組解析組蛋白新型修飾H3Q5ser調(diào)控HCC的發(fā)生機制

TGM2-mediated histone serotonylation promotes HCC progression via MYC signalling pathway

期刊:Journal of Hepatology|影響因⼦:33|發(fā)表時間:2025|發(fā)表單位:華中科技大學(xué)同濟醫(yī)學(xué)院


研究背景:

    肝細胞癌(HCC)是一種侵襲性極強的惡性腫瘤,目前有效的治療手段有限。H3Q5ser是一種由轉(zhuǎn)谷氨酰胺酶2(TGM2)介導(dǎo)的、基于5-羥色胺的組蛋白修飾,影響著包括神經(jīng)發(fā)育在內(nèi)的多種生物學(xué)過程。然而,TGM2介導(dǎo)的H3Q5ser在HCC進展中的作用尚不清楚。本研究探討了TGM2在促進HCC進展中的作用,并評估了其作為HCC治療潛在靶點的可能性。

研究結(jié)果:

    TGM2的表達與甲胎蛋白水平升高、分化差以及更晚期的BCLC分期呈正相關(guān)。TGM2缺失或抑制H3Q5ser修飾可顯著抑制肝細胞癌(HCC)的進展。CUT&Tag和RNA測序分析顯示,經(jīng)TGM2抑制劑處理后,下調(diào)的基因富集在MYC通路中。此外,轉(zhuǎn)錄中介因子1β(TIF1β)介導(dǎo)了TGM2向MYC的招募,從而促進了MYC靶基因上的H3Q5ser修飾。最后,靶向TGM2的谷氨酰胺轉(zhuǎn)胺酶活性在臨床前模型中顯著抑制了HCC的進展,并顯示出與索拉非尼治療的協(xié)同作用。TGM2抑制劑未引起明顯的骨髓抑制或組織損傷。


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圖:H3Q5ser修飾增強MYC靶基因的轉(zhuǎn)錄


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