標(biāo)題

科研服務(wù)實(shí)驗(yàn)室

符合國家IS0 9001標(biāo)準(zhǔn)，實(shí)驗(yàn)操作流程實(shí)行內(nèi)部管理標(biāo)準(zhǔn)化、可追溯。
樣本處理及建庫系統(tǒng)

樣本處理及建庫系統(tǒng) / 二代測序系統(tǒng)
二代測序系統(tǒng)

二代測序系統(tǒng)

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武漢愛基百客生物科技有限公司（簡稱愛基百客），位于武漢高農(nóng)生物園，辦公面積逾3000平方米，是一家專注于表觀組學(xué)、單細(xì)胞時(shí)空組學(xué)和高通量測序分析服務(wù)的新型生物科技企業(yè)。

公司旨在為客戶提供專業(yè)的科研服務(wù)，運(yùn)營至今合作的科研客戶近千家，涵蓋國內(nèi)知名科研院所、高校以及相關(guān)生物企業(yè)，運(yùn)營至今銷售額超1億元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國際高水平學(xué)術(shù)期刊發(fā)表，受到了客戶廣泛好評，是國內(nèi)成長最迅速的多組學(xué)科研服務(wù)企業(yè)之一。

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核酸蛋白互作組學(xué)

基因組相關(guān)研究

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核酸甲基化修飾

染色質(zhì)圖譜

轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)研究

單細(xì)胞時(shí)空組學(xué)

綜合項(xiàng)目服務(wù)

三代測序

CirMD循環(huán)腫瘤DNA

MiGM消費(fèi)級基因檢測

CirAG衰老參數(shù)檢測

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TECHNOLOGY SERVICE

科技服務(wù)

網(wǎng)站首頁 >> 科技服務(wù) >>核酸蛋白互作組學(xué) >> DAP-seq

详细说明

DAP-seq

產(chǎn)品介紹
案例分享

DAP-seq（DNA affinity purification sequencing）

產(chǎn)品介紹：

DAP-Seq是將蛋白質(zhì)體外表達(dá)技術(shù)與高通量測序技術(shù)相結(jié)合，使用體外表達(dá)的TF蛋白對裸露的全基因組DNA片段進(jìn)行孵育，以確定結(jié)合序列。

通過提取基因組DNA，進(jìn)行基因組DNA文庫構(gòu)建。隨后利用HaloTag載體，將目的蛋白與HaloTag融合表達(dá)，將純化的融合蛋白與基因組文庫進(jìn)行孵育，利用目的蛋白結(jié)合DNA片段，并且利用HaloTag特異性磁珠，將目的蛋白和DNA復(fù)合物進(jìn)行提取與純化，隨后對捕獲的DNA片段進(jìn)行擴(kuò)增，測序分析，探究目的蛋白結(jié)合的DNA片段。

DAP原理圖.png

DAP-seq實(shí)驗(yàn)流程

分析流程：

DAP分析流程.png

產(chǎn)品優(yōu)勢：

DAP產(chǎn)品優(yōu)勢.png

項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)：

樣本要求：

植物組織：≥5g

包含轉(zhuǎn)錄因子CDS序列的質(zhì)粒：1-2μg（質(zhì)粒濃度為200 ng/μL）。（需保證質(zhì)粒測序結(jié)果無誤）

建庫測序：

測序策略：NovaSeq6000, PE150

測序深度：6-12 G

項(xiàng)目周期：

60個(gè)工作日

案例分析

【項(xiàng)⽬⽂章】《WRKY27-RAP2.7調(diào)控模塊通過調(diào)節(jié)肉桂醇脫氫酶7和谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶F6，以此調(diào)控木質(zhì)素生物合成和氧化還原穩(wěn)態(tài)，進(jìn)而促進(jìn)耐冷性》

WRKY27-RAP2.7 Regulatory Module Promotes Cold Tolerance via Modulation of Lignin Biosynthesis and Redox Homeostasis by Regulating Cinnamyl Alcohol Dehydrogenase 7 and Glutathione S-Transferase F6

期刊：Plant Biotechnology Journal｜影響因⼦：10.5｜發(fā)表時(shí)間：2025年｜發(fā)表單位：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)

研究背景：

低溫脅迫會(huì)對植物的生長發(fā)育產(chǎn)生不利影響，嚴(yán)重制約柑橘果實(shí)的產(chǎn)量和品質(zhì)。宜昌橙（Citrus ichangensis）作為一種耐寒柑橘種質(zhì)，是研究耐寒適應(yīng)性的寶貴遺傳資源，但目前關(guān)于其低溫脅迫響應(yīng)背后的關(guān)鍵基因及其作用機(jī)制仍鮮有探索。

研究結(jié)果：

通過DAP-seq和RNA-seq揭示了通過調(diào)控CiCAD7介導(dǎo)的桔皮素生物合成和CiGSTF6依賴的ROS清除來調(diào)節(jié)抗寒性，此外，CiWRKY27還與受其調(diào)控的CiRAP2.7蛋白相互作用，形成一個(gè)關(guān)鍵的抗寒調(diào)控模塊。為深入了解低溫脅迫下桔皮素生物合成和ROS穩(wěn)態(tài)的分子調(diào)控機(jī)制提供了有價(jià)值的信息，為柑橘等作物抗寒性的改良提供了有前景的分子模型。