標(biāo)題

科研服務(wù)實驗室

符合國家IS0 9001標(biāo)準(zhǔn)，實驗操作流程實行內(nèi)部管理標(biāo)準(zhǔn)化、可追溯。
樣本處理及建庫系統(tǒng)

樣本處理及建庫系統(tǒng) / 二代測序系統(tǒng)
二代測序系統(tǒng)

二代測序系統(tǒng)

首頁

企業(yè)文化
公司榮譽
加入我們
聯(lián)系我們

加入我們

關(guān)于我們

武漢愛基百客生物科技有限公司（簡稱愛基百客），位于武漢高農(nóng)生物園，辦公面積逾3000平方米，是一家專注于表觀組學(xué)、單細胞時空組學(xué)和高通量測序分析服務(wù)的新型生物科技企業(yè)。

公司旨在為客戶提供專業(yè)的科研服務(wù)，運營至今合作的科研客戶近千家，涵蓋國內(nèi)知名科研院所、高校以及相關(guān)生物企業(yè)，運營至今銷售額超1億元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國際高水平學(xué)術(shù)期刊發(fā)表，受到了客戶廣泛好評，是國內(nèi)成長最迅速的多組學(xué)科研服務(wù)企業(yè)之一。

加入我們

核酸蛋白互作組學(xué)

基因組相關(guān)研究

多組學(xué)

核酸甲基化修飾

染色質(zhì)圖譜

轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)研究

單細胞時空組學(xué)

綜合項目服務(wù)

三代測序

CirMD循環(huán)腫瘤DNA

網(wǎng)站首頁

TECHNOLOGY SERVICE

科技服務(wù)

網(wǎng)站首頁 >> 科技服務(wù) >>核酸蛋白互作組學(xué) >> RIP-seq

详细说明

RIP-seq

產(chǎn)品介紹
案例分析

RIP-seq（RNA Immunoprecipitation sequencing）

產(chǎn)品介紹：

RNA免疫共沉淀（RNA Immunoprecipitation，RIP）是研究細胞內(nèi)RNA與蛋⽩結(jié)合情況的技術(shù)，RIP利⽤⽬標(biāo)蛋⽩的抗體將相應(yīng)的RNA-蛋⽩復(fù)合物（RBP）沉淀下來，分離純化捕獲的RNA，結(jié)合⾼通量測序技術(shù)對⽬標(biāo)RNA 進⾏測序分析。RIP可以看成是普遍使⽤的染⾊質(zhì)免疫沉淀 ChIP 技術(shù)的類似應(yīng)⽤，蛋⽩結(jié)合對象為RNA，RIP-seq即對富集得到的RNA ⽚段進⾏⾼通量測序，是了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控⽹絡(luò)動態(tài)過程的有⼒⼯具，能夠有效探究在基因組范圍內(nèi)發(fā)現(xiàn)與蛋⽩或蛋⽩復(fù)合物相結(jié)合的RNA。

圖：RIP-seq實驗流程

技術(shù)路線：

RIP技術(shù)路線.png

樣本要求：

細胞：≥1×107個

動物組織：≥5 g

植物組織：≥5 g

真核微生物：500mg

建庫測序：

測序策略：NovaSeq6000, PE150

測序深度：6-12 G

項目周期：

45個工作日

案例分析

【項⽬⽂章】《hnRNPU是小鼠精原干細胞庫建立所必需的》

hnRNPU is required for spermatogonial stem cell pool establishment in mice

期刊：Cell Reports｜影響因⼦：6.9｜發(fā)表時間：2024年｜發(fā)表單位：華中科技大學(xué)同濟醫(yī)學(xué)院

研究背景：

精原干細胞（SSCs）是負責(zé)精子發(fā)生的干細胞，具有自我更新和分化產(chǎn)生功能性精子的能力。SSCs的持續(xù)再生對于維持雄性生育力至關(guān)重要。然而，SSC池的發(fā)育起源尚不清楚。在哺乳動物中，SSCs源自名為 prospermatogonia（ProSG）的前精原細胞，依次發(fā)育為增殖型前精原細胞（M-ProSG）、初級過渡型前精原細胞（T1-ProSG）和次級過渡型前精原細胞（T2-ProSG）三種類型。ProSG的遷移和分化過程對于SSC池的建立至關(guān)重要，但這一過程的調(diào)控機制仍不完全清楚。

研究結(jié)果：

在此，我們證實了 hnRNPU 對于精原干細胞（SSC）庫的建立至關(guān)重要。在雄性小鼠中，前精原細胞（ProSG）中 hnRNPU 的條件性缺失會導(dǎo)致精子發(fā)生停滯并引致不育。hnRNPU 缺陷型前精原細胞無法分化并遷移至基底膜，從而無法在幼年期建立 SSC 庫。此外，hnRNPU 的缺失導(dǎo)致前精原細胞積聚，并破壞了 T1 型前精原細胞向 T2 型前精原細胞的轉(zhuǎn)變過程。單細胞轉(zhuǎn)錄組分析顯示，生殖細胞處于有絲分裂靜止?fàn)顟B(tài)，并且在 hnRNPU 耗竭后喪失了其獨特的身份特征。我們進一步表明，hnRNPU 能夠結(jié)合 Vrk1、Slx4 和 Dazl 的轉(zhuǎn)錄本，這些轉(zhuǎn)錄本已被發(fā)現(xiàn)在 hnRNPU 缺陷的睪丸中存在異常的選擇性剪接。這些觀察結(jié)果為 SSC 庫的建立提供了重要見解，并可能對男性生育能力具有轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)意義。