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宏基因組測序
宏基因組測序 產品介紹： 宏基因組測序（Metagenome sequencing ）是由Handelsman等在1998年提出的概念，其定義為“the genome of the total microbiota found in nature ”，即環境中所有微⽣物基因組的總和。宏基因組主要以環境樣品中的微⽣物群體基因組為研究對象，以功能基因篩選和/或測序分析為研究⼿段，以微⽣物多樣性、種群結果、進化關系、功能活性、互作關系及環境之間的關系為研究⽬的的新的微⽣物研究⽅法。 技術路線：
樣本要求： 基因DNA樣品量：≥ 3μg DNA濃度：≥20ng/μl DNA體積：≥15μl
建庫測序： 測序策略：PE150 測序量：10G
項目周期： 45個工作日 案例分享 【項目文章】《綜合性肺部微生物基因與基因組目錄助力引發豬肺部病變的豬肺炎支原體菌株機制研究》 Comprehensive lung microbial gene and genome catalogs assist the mechanism survey of Mesomycoplasma hyopneumoniae strains causing pig lung lesions 期刊：iMeta｜影響因⼦：33.2｜發表時間：2024｜發表單位：江西農業大學 研究背景： 了解下呼吸道微生物組的群落結構對于闡明其在呼吸道疾病中的作用至關重要。然而，由于難以從健康個體和患病個體中獲取微生物樣本，相關研究目前仍然較少。 研究結果： 本研究構建首個豬肺部微生物宏基因組參考目錄，涵蓋噬肉支原體（M. hyopneumoniae）全基因組多樣性。宏基因組測序分析揭示不同致病力菌株在碳水化合物代謝、細胞黏附及免疫逃逸相關基因簇的顯著差異。通過比較基因組學，鑒定出高致病株特有的毒力島和相變異基因，闡明其通過表面抗原變異躲避宿主清除的機制。整合轉錄組數據構建菌株-宿主互作網絡，發現特定菌株刺激促炎因子風暴的關鍵效應分子。研究為豬呼吸道疾病精準防控提供了分子流行病學依據和新型疫苗靶點。
圖：構建豬下呼吸道微生物組的宏基因組組裝基因組（MAGs） |
