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樣本處理及建庫系統 / 二代測序系統
二代測序系統

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武漢愛基百客生物科技有限公司（簡稱愛基百客），位于武漢高農生物園，辦公面積逾3000平方米，是一家專注于表觀組學、單細胞時空組學和高通量測序分析服務的新型生物科技企業。

公司旨在為客戶提供專業的科研服務，運營至今合作的科研客戶近千家，涵蓋國內知名科研院所、高校以及相關生物企業，運營至今銷售額超1億元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國際高水平學術期刊發表，受到了客戶廣泛好評，是國內成長最迅速的多組學科研服務企業之一。

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網站首頁 >> 科技服務 >>基因組相關研究 >> ddRAD-seq

详细说明

ddRAD-seq

產品介紹
案例分享

ddRAD-seq（Double Digest Restriction-site associated DNA sequencing）

產品介紹：

簡化基因組測序是指利用限制性內切酶打斷基因組DNA，對特定片段進行高通量測序獲得海量遺傳多態性標簽序列來充分代表目標物種全基因組信息的測序策略。ddRAD-seq（Restriction-site associated DNA sequencing）技術是在二代測序基礎上發展起來的一項基于全基因組酶切位點的簡化基因組測序技術。該方法技術流程簡單，不受有無參考基因組的限制，可大大簡化基因組的復雜性，減少實驗費用，通過一次測序就可以獲得數以萬計的多態性標記。

圖：ddRAD-seq實驗流程

技術流程：

樣本要求：

DNA樣品量≥ 3μg，OD260/280:1.8-2.0

建庫測序：

測序策略：Illumina Hiseq, PE150

測序深度：至少1×（組裝樣本至少5×）

項目周期：

33個工作日

案例分享

【項目文章】《基于ddRAD測序的油茶雜交群體遺傳變異及與果實性狀的關聯分析》

Genetic Variation in a Crossing Population of Camellia oleifera Based on ddRAD Sequencing and Analysis of Association with Fruit Traits

期刊：Curr Issues Mol Biol | 影響因子：3.0 | 發表時間：2025 | 發表單位：福建農林大學

研究背景：

茶油是一種源自木本植物的重要優質食用油。在中國，油茶（Camellia oleifera）是山茶屬中種植面積最大、分布最廣的油料植物，其種子是獲取茶油的最主要來源。在當前的研究中，提高茶油的產量和品質是油茶遺傳育種的主要目標。本研究旨在調查一個油茶早期雜交群體的遺傳變異程度，并鑒定與果實性狀顯著相關的單核苷酸多態性（SNP）及基因，從而為未來的性狀改良提供分子標記輔助選擇和基因編輯的基礎。

研究結果：

該研究選擇了一個樹齡約40年的油茶雜交群體，共計330個樣本。隨后，利用ddRAD測序技術進行了SNP檢測和群體遺傳分析，并對連續兩年重復測定的果實性狀進行了關聯分析。研究結果表明，鑒定出的高質量SNP超過800萬個，但絕大多數SNP位于基因間區。該群體的核苷酸多態性處于較低水平，且Tajima's D值大多大于0，表明該群體的變異不符合中心進化模型。群體結構分析顯示，該群體有7個理論上的遺傳物質來源，可分為7個類群，聚類分析結果也支持了群體結構分析的結論。關聯分析鑒定出了與單果種子數和種仁含油率基因相關的顯著SNP。該研究的發現為栽培油茶的分子育種和未來的遺傳改良提供了依據。