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樣本處理及建庫系統 / 二代測序系統
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武漢愛基百客生物科技有限公司（簡稱愛基百客），位于武漢高農生物園，辦公面積逾3000平方米，是一家專注于表觀組學、單細胞時空組學和高通量測序分析服務的新型生物科技企業。

公司旨在為客戶提供專業的科研服務，運營至今合作的科研客戶近千家，涵蓋國內知名科研院所、高校以及相關生物企業，運營至今銷售額超1億元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國際高水平學術期刊發表，受到了客戶廣泛好評，是國內成長最迅速的多組學科研服務企業之一。

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SSR

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SSR

簡單重復序列(SSR)也稱微衛星DNA，也可稱為SSRP(Simple Sequence Repeat Polymorphisms)，STMS (Sequence-tagged microsatellites)。其串聯重復的核心序列為1-6 bp，其中最常見是雙核苷酸重復，即(CA) n和(TG) n每個微衛星DNA的核心序列結構相同，重復單位數目10一60個，其高度多態性主要來源于串聯數目的不同。SSR標記的基本原理：根據微衛星序列兩端互補序列設計引物，通過PCR反應擴增微衛星片段，由于核心序列串聯重復數目不同，因而能夠用PCR的方法擴增出不同長度的PCR產物，將擴增產物進行凝膠電泳，根據分離片段的大小決定基因型并計算等位基因頻率。SSR屬于第二代遺傳標記，可用于遺傳制圖、基因定位、法醫學鑒定、人類學以及遺傳病診斷等多個領域。

技術流程：

客戶提供：

樣本：動物組織0.4 g、細胞10⁷以上或植物組織樣本2 g以上；

引物信息、數據分析具體要求。

最終交付：

實驗報告：含完整的實驗流程、PCR電泳照片、大板膠檢測圖、測序峰圖和數據分析結果等。

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《EST-SSR標記用于杜鵑花的遺傳多樣性分析》

De novo assembly of transcriptome from Rhododendron latoucheae Franch. using Illumina sequencing and development of new EST-SSR markers for genetic diversity analysis in Rhododendron.

Tree Genetics & Genomes, 2017, 13(3):1-14.（IF=1.862）

研究背景：

杜鵑花以其艷麗的花朵而聞名于世，鹿角杜鵑是一種適應性強、海拔范圍分布廣的杜鵑花，具有美麗的香花和藥用功效。然而，杜鵑花的遺傳研究一直受限于有限的基因組資源和遺傳標記。

研究結果：

在這項研究中，杜鵑花轉錄組衍生出的80660個單基因組成一個龐大的數據庫。在這些單基因中，34867個單基因（43.22%）被注釋為公共蛋白質數據庫。此外，從16019個單基因序列中鑒定出14415個EST-SSR，平均每2.87 kb有一個SSR。其中雙核苷酸SSR最豐富（80.03%），其次是三核苷酸（18.82%）、四核苷酸（0.91%）、五核苷酸（0.13%）和六核苷酸（0.11%）。進一步研究，篩選出200對具有6個以上串聯重復序列的引物，其中58對引物擴增成功，顯示出6個杜鵑品種的多態性。在這58對引物中，37對引物來自37種杜鵑花和中國本土的兩大群體中的30個鹿角杜鵑個體中具有多態性。共鑒定出382個等位基因，平均每個位點10.3個等位基因。系統發育樹、遺傳結構分析和主成分分析表明，主要類群與已知的系統發育樹和地理分布相對應。這些轉錄組數據將有助于杜鵑的基因發掘和功能基因組研究，并且新開發的EST-SSR標記可應用于多種杜鵑屬植物中，并用于評價杜鵑屬植物的遺傳關系。