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武漢愛基百客生物科技有限公司(簡(jiǎn)稱愛基百客),位于武漢高農(nóng)生物園,辦公面積逾3000平方米,是一家專注于表觀組學(xué)、單細(xì)胞時(shí)空組學(xué)和高通量測(cè)序分析服務(wù)的新型生物科技企業(yè)。


公司旨在為客戶提供專業(yè)的科研服務(wù),運(yùn)營(yíng)至今合作的科研客戶近千家,涵蓋國(guó)內(nèi)知名科研院所、高校以及相關(guān)生物企業(yè),運(yùn)營(yíng)至今銷售額超1億元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國(guó)際高水平學(xué)術(shù)期刊發(fā)表,受到了客戶廣泛好評(píng),是國(guó)內(nèi)成長(zhǎng)最迅速的多組學(xué)科研服務(wù)企業(yè)之一。

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详细说明

空間轉(zhuǎn)錄組(Visium Spatial Gene Expression)

  • 產(chǎn)品介紹
  • 案例分析

空間轉(zhuǎn)錄組(Visium Spatial Gene Expression


產(chǎn)品介紹:

細(xì)胞之間的關(guān)系以及它們?cè)诮M織樣本中的相對(duì)位置對(duì)于⽣命活動(dòng)具有重要影響,空間轉(zhuǎn)錄組是將mRNA的表達(dá)豐度與空間位置結(jié)合,為細(xì)胞功能、表型和組織微環(huán)境中位置的關(guān)系提供了重要信息。其原理是當(dāng)組織冷凍切⽚附在空間轉(zhuǎn)錄組載⽚上時(shí),條形碼引物結(jié)合并從組織中捕獲臨近的mRNA。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄,得到的cDNA中包含了空間條形碼。分析Illumina測(cè)序結(jié)果中空間條形碼的序列,可以將每個(gè)mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切⽚中的真實(shí)位置。


技術(shù)流程

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芯片原理

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樣本要求:

新鮮組織OCT包埋


建庫測(cè)序:

測(cè)序量:5M reads / spot


項(xiàng)目周期:

40個(gè)工作日


案例分享

【項(xiàng)⽬⽂章】《單細(xì)胞和空間組學(xué)分析揭⽰了乳腺癌的細(xì)胞異質(zhì)性》

Single-cellandspatiallyresolvedanalysisuncoverscellheterogeneityofbreastcancer

期刊:JHEMATOLONCOL|影響因⼦:23.168|發(fā)表時(shí)間:2022年|發(fā)表單位:武漢⼤學(xué)⼈⺠醫(yī)院



研究背景:

乳腺癌常常被稱為“粉紅殺⼿”,其發(fā)病率居于⼥性惡性腫瘤的⾸位。乳腺癌(BC)的特征之⼀是復(fù)雜的細(xì)胞⽣態(tài)系統(tǒng),基于乳腺癌分⼦分型的診斷和治療取得了重⼤進(jìn)展,但其內(nèi)部的異質(zhì)性尚不清楚。在該研究中,作者的⽬標(biāo)是結(jié)合兩種互補(bǔ)的⾼分辨率組學(xué)(單細(xì)胞核RNA測(cè)序和空間轉(zhuǎn)錄組)⼯具來解讀乳腺癌的異質(zhì)性和復(fù)雜結(jié)構(gòu)。


研究結(jié)果:

在該研究中,作者發(fā)現(xiàn)乳腺癌惡性細(xì)胞分為不同的亞群,這些亞群有不同的功能、特征和起源, 亞群映射到不同的組織區(qū)域。另外,通過分析推斷這些腫瘤亞群的豐度,揭⽰患者⽣存率和治療反應(yīng)的差異關(guān)系。總之,該研究提供了⼀個(gè)描繪乳腺癌異質(zhì)性和結(jié)構(gòu)的綜合性⽅法。同時(shí), 它也將有助于臨床醫(yī)⽣對(duì)乳腺癌“分⻔別類”的精準(zhǔn)治療。

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圖:空間轉(zhuǎn)錄組分析和細(xì)胞類型的反褶積

 



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