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武漢愛基百客生物科技有限公司(簡(jiǎn)稱愛基百客),位于武漢高農(nóng)生物園,辦公面積逾3000平方米,是一家專注于表觀組學(xué)、單細(xì)胞時(shí)空組學(xué)和高通量測(cè)序分析服務(wù)的新型生物科技企業(yè)。


公司旨在為客戶提供專業(yè)的科研服務(wù),運(yùn)營(yíng)至今合作的科研客戶近千家,涵蓋國(guó)內(nèi)知名科研院所、高校以及相關(guān)生物企業(yè),運(yùn)營(yíng)至今銷售額超1億元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國(guó)際高水平學(xué)術(shù)期刊發(fā)表,受到了客戶廣泛好評(píng),是國(guó)內(nèi)成長(zhǎng)最迅速的多組學(xué)科研服務(wù)企業(yè)之一。

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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組10xGenomics

  • 產(chǎn)品介紹
  • 案例分享

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組(scRNA-seq


產(chǎn)品介紹:

10x Genomics利⽤微流控、油滴包裹、barcode的技術(shù)⼿段在單個(gè)細(xì)胞層⾯對(duì)細(xì)胞mRNA進(jìn)⾏⾼通量測(cè)序。針對(duì)制備成功的單細(xì)胞懸液,通過(guò)微流控技術(shù)分選單個(gè)細(xì)胞,然后將帶有barcode和引物的凝膠珠與單個(gè)細(xì)胞包裹在油滴中,形成GEMsGEMs形成后,在GEMs中完成細(xì)胞的裂解以及mRNA的捕獲,隨后mRNA逆轉(zhuǎn)錄最終⽣成含有10x BarcodeUMIcDNA,最后進(jìn)⾏測(cè)序⽂庫(kù)的構(gòu)建與測(cè)序分析。10x Genomics單細(xì)胞平臺(tái)細(xì)胞捕獲率最⾼65%,單個(gè)樣本建議捕獲500 - 10000個(gè)細(xì)胞,⼀張芯⽚可完成80,000個(gè)細(xì)胞的捕獲,結(jié)合配套分析軟件,可⼀次性獲得⼤量單細(xì)胞的基因表達(dá)數(shù)據(jù)。現(xiàn)10x Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序⼴泛應(yīng)⽤于動(dòng)植物細(xì)胞圖譜構(gòu)建、稀有細(xì)胞類型鑒定、疾病發(fā)⽣機(jī)制解析、發(fā)育分化機(jī)制研究等⽅⾯。


技術(shù)流程:

image.png


樣本要求:

總量≥105⽬標(biāo)細(xì)胞個(gè)數(shù)(最少10,000個(gè)細(xì)胞);

細(xì)胞間⽆粘連(成團(tuán)率<5%);

⽆⼤于40μm的細(xì)胞碎⽚或其他顆粒物; 

不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和⾮細(xì)胞的核酸分⼦;

濃度700-1,200 個(gè)/μl; 

細(xì)胞成活率應(yīng)⼤于85%

有完整的基因組。


建庫(kù)測(cè)序:

測(cè)序量:100G


項(xiàng)目周期:

40個(gè)⼯作⽇




案例分享

【項(xiàng)⽬⽂章】《膠質(zhì)⺟細(xì)胞瘤惡性細(xì)胞與⾎管細(xì)胞譜系關(guān)系的解析》

Resolvingthelineagerelationshipbetweenmalignantcellsandvascularcellsinaglioblastomas

期刊:Protein&Cell|影響因⼦:15.328|發(fā)表時(shí)間:2022年|發(fā)表單位:武漢⼤學(xué)中南醫(yī)院


研究背景:

多形膠質(zhì)⺟細(xì)胞瘤(Glioblastoma  multiform, GBM)是⼀種⾼度惡性、異質(zhì)性的腦腫瘤,包含多種類型的腫瘤和⾮腫瘤細(xì)胞。GBM細(xì)胞是否可以轉(zhuǎn)分化為⾮神經(jīng)細(xì)胞類型,包括壁細(xì)胞或內(nèi)⽪細(xì)胞,以⽀持腫瘤⽣⻓和侵襲仍存在爭(zhēng)議。破譯GBM微環(huán)境的細(xì)胞組成和譜系歷史,包括內(nèi)⽪細(xì)胞、壁細(xì)胞和腫瘤相關(guān)的⼩膠質(zhì)細(xì)胞和巨噬細(xì)胞,對(duì)開發(fā)GBM的靶向治療具有重要意義。GBM細(xì)胞被認(rèn)為起源于突變的神經(jīng)⼲細(xì)胞/祖細(xì)胞。先前的研究表明,GBM⼲細(xì)胞可能產(chǎn)⽣⾎管內(nèi)⽪細(xì)胞(ECs)或壁細(xì)胞⽀持腫瘤⽣⻓和侵襲。作者早期的研究還發(fā)現(xiàn),⼲細(xì)胞標(biāo)志物既可以標(biāo)記膠質(zhì)瘤⼲細(xì)胞樣細(xì)胞,也可以標(biāo)記壁細(xì)胞,提⽰膠質(zhì)⺟細(xì)胞瘤細(xì)胞可能存在跨譜系的轉(zhuǎn)分化。最新的單細(xì)胞技術(shù)結(jié)合譜系追蹤分析,對(duì)理解在發(fā)育過(guò)程、組織穩(wěn)態(tài)、再⽣和 病理?xiàng)l件下的細(xì)胞成分、細(xì)胞狀態(tài)和命運(yùn)分化有深刻的意義。


研究?jī)?nèi)容:

該研究在⼩⿏中⽣成了2個(gè)遺傳GBM模型,模擬⼈類GBM的基礎(chǔ)病理和分⼦特征。作者對(duì)譜系進(jìn)⾏了追蹤,并利⽤單細(xì)胞RNA-seq對(duì)拷⻉數(shù)變異進(jìn)⾏了分析。該研究促進(jìn)了對(duì)GBM細(xì)胞譜系潛⼒的理解,并可能為GBM患者的靶向治療提供⻅解。

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圖:NPCTKD GBM樣本中⾎管細(xì)胞和惡性細(xì)胞的CNV模式和分布



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公司主要提供表觀組學(xué)技術(shù)服務(wù)、NGS測(cè)序服務(wù)、單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)

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