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武漢愛基百客生物科技有限公司(簡稱愛基百客),位于武漢高農生物園,辦公面積逾3000平方米,是一家專注于表觀組學、單細胞時空組學和高通量測序分析服務的新型生物科技企業。


公司旨在為客戶提供專業的科研服務,運營至今合作的科研客戶近千家,涵蓋國內知名科研院所、高校以及相關生物企業,運營至今銷售額超1億元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國際高水平學術期刊發表,受到了客戶廣泛好評,是國內成長最迅速的多組學科研服務企業之一。

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TECHNOLOGY SERVICE

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EMSA

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  • 案例分享

EMSA(electrophoretic mobility shift assay)


產品介紹:

凝膠遷移實驗是⼀種體外研究蛋白和DNA相互作用的實驗。通常將純化的蛋白和攜帶標記物的DNA探針⼀同孵育,在非變性的聚丙烯凝膠電泳上,DNA與蛋白結合復合物比非結合的探針移動得慢,通過探針遷移速度快慢評估⽬的蛋白與DNA是否結合。在實驗上會通過冷競爭探針和突變探針進⼀步驗證蛋白和DNA結合情況。


技術路線:

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樣本要求:

探針序列或探針:明確的探針序列或已合成探針

純化蛋白:1mg /ml,100μg以上(也可委托公司進行蛋白表達與純化)

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最終交付:

實驗報告:含完整的實驗流程、實驗結果數據及圖片。


案例分享


【項⽬⽂章】《整合ATAC測序與RNA測序揭示RcHSF30通過調控sHSP和BAG實現玫瑰的熱耐受性》

Integrated ATAC-seq and RNA-seq reveal RcHSF30 regulating sHSP and BAG for thermotolerance in rose

期刊:Industrial Crops & Products | 影響因⼦:6.2|發表時間:2025年|發表單位:中南林業科技大學


研究背景:

高溫嚴重阻礙了月季在園林景觀中的應用,并對切花的產量和品質產生負面影響。然而,目前關于月季熱應激反應(HSR)的轉錄調控網絡仍知之甚少。

研究結果:

研究對熱脅迫下的月季(Rosa chinensis)進行了ATAC-seq和RNA-seq分析,揭示了在熱暴露兩小時內染色質可及性的動態變化。研究發現,啟動子區域的差異可及區域(DARs)呈現下調趨勢,而基因間區的DARs則呈現上調趨勢。在四個時間點上,與上調DARs相關的熱激活基因富集在與抗逆性相關的通路中。值得注意的是,熱響應基因在其可及區域內富含大量的熱休克因子(HSF)結合基序。小分子熱休克蛋白基因(HSP18.1)和Bcl-2相關去乃基因(BAG6)顯示出最強的染色質可及性與表達量的相關性,且在其啟動子中含有HSF順式作用元件。研究鑒定出RcHSF30(HSFA2家族成員)在熱脅迫期間顯著上調。分子對接分析和凝膠遷移率實驗(EMSA)證實,RcHSF30能夠結合到RcHSP18.1和RcBAG6的可及啟動子區域。在轉基因玫瑰(R. rugosa)中過表達RcHSF30增強了植株的耐熱性,減少了活性氧(ROS)的積累,并上調了HSP18.1和BAG6的表達。本研究闡明了月季熱應激反應背后的表觀遺傳調控機制,為培育耐熱月季新品種奠定了基礎。

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圖:RcHSF30與RcHSP18.1/RcBAG 6之間的相互作用

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