標(biāo)題

科研服務(wù)實(shí)驗(yàn)室

符合國(guó)家IS0 9001標(biāo)準(zhǔn)，實(shí)驗(yàn)操作流程實(shí)行內(nèi)部管理標(biāo)準(zhǔn)化、可追溯。
樣本處理及建庫(kù)系統(tǒng)

樣本處理及建庫(kù)系統(tǒng) / 二代測(cè)序系統(tǒng)
二代測(cè)序系統(tǒng)

二代測(cè)序系統(tǒng)

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武漢愛(ài)基百客生物科技有限公司（簡(jiǎn)稱(chēng)愛(ài)基百客），位于武漢高農(nóng)生物園，辦公面積逾3000平方米，是一家專(zhuān)注于表觀組學(xué)、單細(xì)胞時(shí)空組學(xué)和高通量測(cè)序分析服務(wù)的新型生物科技企業(yè)。

公司旨在為客戶(hù)提供專(zhuān)業(yè)的科研服務(wù)，運(yùn)營(yíng)至今合作的科研客戶(hù)近千家，涵蓋國(guó)內(nèi)知名科研院所、高校以及相關(guān)生物企業(yè)，運(yùn)營(yíng)至今銷(xiāo)售額超1億元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國(guó)際高水平學(xué)術(shù)期刊發(fā)表，受到了客戶(hù)廣泛好評(píng)，是國(guó)內(nèi)成長(zhǎng)最迅速的多組學(xué)科研服務(wù)企業(yè)之一。

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核酸蛋白互作組學(xué)

基因組相關(guān)研究

多組學(xué)

核酸甲基化修飾

染色質(zhì)圖譜

轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)研究

單細(xì)胞時(shí)空組學(xué)

綜合項(xiàng)目服務(wù)

三代測(cè)序

CirMD循環(huán)腫瘤DNA

MiGM消費(fèi)級(jí)基因檢測(cè)

CirAG衰老參數(shù)檢測(cè)

項(xiàng)目管理系統(tǒng)

客戶(hù)服務(wù)系統(tǒng)

網(wǎng)站首頁(yè)

TECHNOLOGY SERVICE

科技服務(wù)

網(wǎng)站首頁(yè) >> 科技服務(wù) >>單細(xì)胞時(shí)空組學(xué) >> 單細(xì)胞多組學(xué)（scATAC-seq+scRNA-seq）

详细说明

單細(xì)胞多組學(xué)（scATAC-seq+scRNA-seq）

產(chǎn)品介紹
案例分享

單細(xì)胞多組學(xué)（scATAC-seq+scRNA-seq）

產(chǎn)品介紹：

單細(xì)胞多組學(xué)是10xGenomics商業(yè)化的用于同時(shí)研究單細(xì)胞染色質(zhì)開(kāi)放性和基因表達(dá)的多組學(xué)解決⽅案。該方案利用⼀份材料，同時(shí)獲得基因表達(dá)和染色質(zhì)開(kāi)放性圖譜。該平臺(tái)樣本利用Tn5轉(zhuǎn)座酶對(duì)細(xì)胞核懸液進(jìn)行轉(zhuǎn)座之后進(jìn)行10xGenomics平臺(tái)的捕獲。單個(gè)凝膠珠（Gel Beads）與細(xì)胞核以及反應(yīng)試劑形成GEMs，而GelBeads上同時(shí)包含了mRNA捕獲序列poly（dT）以及染色質(zhì)開(kāi)放性捕獲序列，后期構(gòu)建基因表達(dá)⽂庫(kù)與ATAC-seq⽂庫(kù)，分析上通過(guò)10xBarcode匹配，實(shí)現(xiàn)同⼀細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組和表觀組共同研究。單細(xì)胞多組學(xué)以多維度為解析生命活動(dòng)機(jī)制提供了新的解決⽅案。

技術(shù)流程：

Gel besds信息：

樣本要求：

總量>10⁵目標(biāo)細(xì)胞個(gè)數(shù)（最少10,000個(gè)細(xì)胞）；
濃度700-1,200個(gè)/μl；
細(xì)胞間⽆粘連（成團(tuán)率<5%）；
⽆⼤于40μm的細(xì)胞碎⽚或其他顆粒物；
細(xì)胞成活率應(yīng)⼤于85%；
不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和⾮細(xì)胞的核酸分⼦；
有完整的基因組。

建庫(kù)測(cè)序：

測(cè)序量：scRNA 100G，scATAC 90G

項(xiàng)目周期：

40個(gè)⼯作⽇

案例分享

【項(xiàng)⽬⽂章】《單細(xì)胞多組學(xué)分析揭⽰了⾯包⼩⻨根系中的不對(duì)稱(chēng)基因表達(dá)和細(xì)胞類(lèi)型特異性調(diào)控⽹絡(luò)》

Asymmetricgeneexpressionandcell-type-specificregulatorynetworks

intherootofbreadwheatrevealedbysingle-cellmultiomicsanalysis

期刊：GenomeBiology｜影響因⼦：17.902｜發(fā)表時(shí)間：2023年｜發(fā)表單位：華中農(nóng)業(yè)⼤學(xué)

研究背景：

同源基因的不對(duì)稱(chēng)表達(dá)在多倍體中普遍存在，這使得顯性位點(diǎn)能控制特定亞基因組中的特定農(nóng)藝性狀。然⽽，⽬前對(duì)同源基因不對(duì)稱(chēng)表達(dá)的理解限于組織或器官層⾯，這些組織或器官由多種細(xì)胞類(lèi)型組成，參考單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄圖譜的缺乏掩蓋了細(xì)胞異質(zhì)性引起的不對(duì)稱(chēng)表達(dá)的細(xì)節(jié)。最近，單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq)在植物中的應(yīng)⽤提⾼了對(duì)各種植物物種中細(xì)胞異質(zhì)性的理解，如擬南芥、⽔稻、⽟⽶、棉花、花⽣和楊樹(shù)。⾯包⼩⻨是⼀種典型的異六倍體物種，與擬南芥和⽔稻相⽐，異源多倍體基因組和對(duì)其⾼地棲息地的適應(yīng)可能有助于⼩⻨中特殊的根組織和轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性。

研究結(jié)果：

在該研究中，研究⼈員利⽤單核RNA測(cè)序(snRNA-seq)和單核轉(zhuǎn)座酶可及染⾊質(zhì)⾼通量測(cè)序分析(snATAC-seq)探索了⼩⻨根組織在單細(xì)胞分辨率下的不對(duì)稱(chēng)基因表達(dá)模式。此外，作者構(gòu)建了控制細(xì)胞⾝份的細(xì)胞類(lèi)型特異性⽹絡(luò)，并通過(guò)結(jié)合細(xì)胞類(lèi)型特異性基因表達(dá)和染⾊質(zhì)可及性，鑒定了驅(qū)動(dòng)細(xì)胞命運(yùn)從分⽣組織細(xì)胞向根⽑轉(zhuǎn)變的新的轉(zhuǎn)錄因⼦。