案例分享

《在野豬和巴⻢豬的脂肪組織中進⾏三維基因組結構的重組》

Reorganization
of
3D
genome
architecture
across
wild
boar
and
Bama
pig
adipose
tissues

期刊：Journal of Animal Science and
Biotechnology
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影響因⼦：6.175
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發表時間：2022年
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發表單位：四川農業⼤學

研究背景：

哺乳動物的基因組被組織成不同的層次，這些層次與基因表達的變化密切相關，甚⾄可能有因果關系 。近年來的研究對豬不同組織和細胞類型的染⾊質組織進⾏了表征，并⽐較了不同物種和豬早期發育過程中的染⾊質組織 。然⽽，⼈們對不同品種豬的染⾊質組織如何不同知之甚少。

研究思路：

研究結果：

在本研究中，對野豬和巴⻢豬的兩個脂肪庫（背部脂肪上層的ULB和⼤⽹膜）進⾏了三維基因組組織分析，并進⾏了轉錄組鑒定。研究發現野豬和巴⻢豬之間超過95%的A/B隔室和拓撲關聯域（TADs）是穩定的。相反，超過70%的啟動⼦增強⼦的相互作⽤是動態的和⼴泛存在的，涉及超過1000個基因。染⾊質結構的改變與基因表達的變化有關，這些基因參與了⼴泛的⽣物學功能，如基本的細胞功能、內分 泌功能、能量代謝和免疫反應。在兩個豬品種中，與重組的A/B隔室和PEIs相關的基因在GOM和ULB之間分別有⼤約95%和97%的差異。

圖：野豬和巴⻢豬Hi-C分析